毎パソの運営団体さんから、早速返答をいただきました。

(過去:毎パソ(毎日パソコン入力コンクール)のルールを見つつ、ふと思う。)
　さすがに丸ごとコピーなんてできないので、再整理して掲示します。

• 一切問題なし。
  • 「ローマ字入力……但しLキーの挙動をXキーと等価(小書き文字)ではなくRキーと等価(ら行)になるよう設定変更」＋「大会指定キーボード」で「ローマ字入力」を行う。
  • 「ローマ字入力……但し「;=っ」「:=ー」を割り当てる」＋「大会指定キーボード」で「ローマ字入力」を行う。
• 予選には参加できるが、全国大会には参加できない。
  • 「Japanist2003の親指シフトエミュレータ」＋「大会指定キーボード」で「親指シフト入力」を行う。
  • 「MS-IMEまたはATOK」＋「姫踊子草」＋「大会指定キーボード」で「親指シフト入力」を行う。
  • 「MS-IMEまたはATOK」＋「姫踊子草」＋「大会指定キーボード」で「JISかな入力(ただしスペースバーでシフト(SandS)の設定)」を行う。
• 予選にも参加できない。
  • 「MS-IMEまたはATOK」＋「IMEのローマ字定義を変更して【チョイかな入力】」＋「大会指定キーボード」で「チョイかな入力」を行う。

　……意図を解釈すると、こういう感じかも。

• ローマ字入力の定義変更について「JISX4063の完全上位互換であること」の条件を満たせば、全国大会まで参加可能。
  • 「;:@」に「っんー」を割り当てても大丈夫かも？
  • 「子音キー同士の連続打鍵に頻出カナを割り当てる」などの場合も含めて、事前に別途問い合わせを要すると思う。
• ローマ字入力の定義変更について「JISX4063の完全上位互換であること」の条件を満たせない変更を行った場合、そもそも予選にすら参加できない。
  • JISX4063と互換性のない配列をローマ字入力テーブル経由で実装してはダメ、ということ。
    • おそらく、AZIKやチーズタイピングなど(両者とも、フル実装するとJISX4063の完全上位互換から外れることになる)もダメになると思う。
      • ただし、「カナ入力として使って、矛盾のない定義」を用いる場合は、上の条件にひっかかることはなく、以下の条件に従うことになる（たとえばAZIKをカナ入力のルールで再定義した、『ああずっといいかな配列』とか）。*1
• キー配列入れ替えソフト(IME内蔵の場合を含む)による配列変更については、予測変換などの「自動入力に関する」補助機能を用いない実装であれば予選での使用は許容される……が、(実装する配列の種類に関係なく)全国大会には参加できない。

　なるほど……これなら確かに(予選部に関しては)矛盾しないのかも。
　ローマ字入力については「JISX4063の完全上位互換であること(独自拡張(方言)部分については許容する)」がルールの根底にあるとすると、個人的には「JISX4063改」でチャレンジする方が現れることを期待してみたいところで。これが「ルールには接触しないかもしれない」というのは興味深い気がします。

　全国大会に関しては……うーん……。
　ソフト同士のコンフリクトを心配しているのかもしれない。というか、それ以外に答えが見つからないんですよね……。
　大会の運用上は仕方がないのかも。

*1:2010年11月2日21:54:30追記。